More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5380 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  100 
 
 
539 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  66.29 
 
 
534 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  60.29 
 
 
549 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  60.98 
 
 
541 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  57.59 
 
 
553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  58.87 
 
 
531 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  56.74 
 
 
539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  58.63 
 
 
536 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  48.87 
 
 
522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  50.19 
 
 
518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  45.35 
 
 
562 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  45.56 
 
 
555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  43.68 
 
 
539 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.18 
 
 
585 aa  341  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  44.47 
 
 
510 aa  319  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  42.2 
 
 
564 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 
571 aa  277  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  37.68 
 
 
592 aa  272  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.42 
 
 
290 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  45.52 
 
 
288 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  47.75 
 
 
312 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  45.21 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  43.33 
 
 
308 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  53.96 
 
 
203 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  46.49 
 
 
311 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  32.28 
 
 
506 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  45.55 
 
 
293 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  53.23 
 
 
203 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.82 
 
 
285 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.29 
 
 
312 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  50.25 
 
 
204 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.1 
 
 
549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  54.87 
 
 
204 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  32.81 
 
 
499 aa  196  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  42.95 
 
 
298 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.74 
 
 
205 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 
325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
292 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  42.91 
 
 
292 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
292 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  44.86 
 
 
288 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  40.96 
 
 
288 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  43.49 
 
 
314 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  49.5 
 
 
201 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  45.71 
 
 
282 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  42.27 
 
 
282 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  51.27 
 
 
235 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  42.52 
 
 
298 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  39.38 
 
 
300 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  42.66 
 
 
285 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  47.24 
 
 
203 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  42.06 
 
 
248 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  35.9 
 
 
323 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  45.45 
 
 
233 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34.56 
 
 
350 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 
310 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.25 
 
 
350 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  37.25 
 
 
339 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 
200 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 
349 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 
348 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
371 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
371 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
359 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
371 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 
344 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.5 
 
 
359 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
359 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.25 
 
 
350 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
371 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.25 
 
 
343 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.49 
 
 
310 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  31.01 
 
 
334 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  34.93 
 
 
310 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  43.81 
 
 
221 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  43.81 
 
 
221 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  43.81 
 
 
221 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.85 
 
 
209 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  35.02 
 
 
339 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  34.59 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  35.55 
 
 
301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.3 
 
 
309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  34.59 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  34.59 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  34.59 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 
356 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.59 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  31.27 
 
 
319 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  34.59 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.72 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  34.59 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.66 
 
 
355 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  35.67 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.01 
 
 
355 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  34.25 
 
 
310 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.72 
 
 
316 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.39 
 
 
316 aa  147  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  35.88 
 
 
331 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 
355 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>