More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2073 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
499 aa  968    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  65.92 
 
 
506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  30.39 
 
 
549 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  34.5 
 
 
553 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  35.34 
 
 
539 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  35.67 
 
 
522 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  35 
 
 
531 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  32.43 
 
 
541 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  34.26 
 
 
562 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  33.07 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  34.23 
 
 
539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  32.81 
 
 
539 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  32.63 
 
 
549 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  35.65 
 
 
564 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  33.93 
 
 
536 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  34.69 
 
 
518 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  32.56 
 
 
555 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  35.23 
 
 
510 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.64 
 
 
585 aa  170  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  38.54 
 
 
310 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.27 
 
 
330 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  32.4 
 
 
571 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  34.92 
 
 
312 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.92 
 
 
334 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  39.8 
 
 
221 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  46.84 
 
 
217 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  32.41 
 
 
592 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  47.72 
 
 
229 aa  143  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  46.81 
 
 
218 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.5 
 
 
246 aa  143  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  40.38 
 
 
218 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  45.03 
 
 
201 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  30.1 
 
 
334 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  36.36 
 
 
237 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  34.31 
 
 
243 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  40.49 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  40.49 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  32.87 
 
 
311 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  40.98 
 
 
218 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  40.89 
 
 
218 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  42.78 
 
 
220 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.59 
 
 
323 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  46.32 
 
 
218 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  38.95 
 
 
226 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  33.79 
 
 
389 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  43.94 
 
 
225 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.77 
 
 
328 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  34.93 
 
 
237 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  44.85 
 
 
218 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  44.85 
 
 
218 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  44.15 
 
 
203 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  45.95 
 
 
225 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  43.88 
 
 
215 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.64 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  44.85 
 
 
218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.41 
 
 
237 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  44.1 
 
 
215 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  30.51 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.89 
 
 
237 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  46.78 
 
 
217 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  39.9 
 
 
230 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.41 
 
 
237 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  39.6 
 
 
240 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  44.33 
 
 
218 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  38.12 
 
 
234 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  44.33 
 
 
218 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  44.33 
 
 
218 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  44.33 
 
 
218 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  31.88 
 
 
315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  39.15 
 
 
290 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  35.27 
 
 
237 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  35.27 
 
 
237 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  44.85 
 
 
259 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.93 
 
 
237 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  44.33 
 
 
256 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  44.33 
 
 
256 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.3 
 
 
325 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  47.06 
 
 
215 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  34.93 
 
 
237 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  37.2 
 
 
233 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  41.71 
 
 
219 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  30.66 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  30.66 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  36.9 
 
 
234 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  34.93 
 
 
237 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  44.1 
 
 
253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  40.4 
 
 
218 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  44.74 
 
 
218 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.5 
 
 
238 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  40.82 
 
 
249 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>