286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1827 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  100 
 
 
310 aa  635    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  46.49 
 
 
322 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  40.74 
 
 
334 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  40.98 
 
 
312 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  41.12 
 
 
311 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  43.24 
 
 
306 aa  225  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  43.06 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  37.91 
 
 
329 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  38.19 
 
 
329 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  38.56 
 
 
329 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  37.91 
 
 
329 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  37.58 
 
 
329 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  37.54 
 
 
329 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  38.44 
 
 
329 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  36.93 
 
 
329 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  37.58 
 
 
320 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  37.58 
 
 
320 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  38.26 
 
 
317 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  37.18 
 
 
315 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  37.09 
 
 
309 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 
389 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  39.59 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.33 
 
 
318 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  39.86 
 
 
344 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  39.48 
 
 
549 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
309 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  39.06 
 
 
335 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 
348 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 
349 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 
305 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  37.04 
 
 
315 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  39.24 
 
 
339 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
343 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 
305 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.95 
 
 
309 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  35.53 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  36.61 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  36.61 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.17 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.17 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.17 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.17 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  35.08 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.84 
 
 
310 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  38.51 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  36.01 
 
 
353 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.84 
 
 
310 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.84 
 
 
310 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.97 
 
 
345 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.84 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  36.55 
 
 
336 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  36.55 
 
 
336 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.16 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  38.11 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.05 
 
 
328 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  36.61 
 
 
304 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  38.26 
 
 
336 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  34.67 
 
 
325 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  37.34 
 
 
309 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  35.14 
 
 
339 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.18 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  38.19 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  35.37 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.04 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.22 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  39.19 
 
 
334 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 
353 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  33.99 
 
 
324 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  34.31 
 
 
324 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  37.11 
 
 
339 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.47 
 
 
310 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.69 
 
 
323 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  34.64 
 
 
323 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  35.14 
 
 
323 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.21 
 
 
325 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  36.36 
 
 
307 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  35.81 
 
 
325 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  34.64 
 
 
323 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  33.65 
 
 
339 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  34.31 
 
 
323 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  34.31 
 
 
323 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  36.33 
 
 
321 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  33.75 
 
 
338 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  35.15 
 
 
316 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  33.22 
 
 
331 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  35.35 
 
 
359 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.15 
 
 
316 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  35.57 
 
 
325 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  34.44 
 
 
314 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  36.39 
 
 
327 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  35.22 
 
 
347 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.6 
 
 
365 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  34.34 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>