More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0095 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  74.58 
 
 		 562 aa  777    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 555 aa  1083    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.16 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  46.63 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  48.99 
 
 		 539 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  49.18 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  47.2 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  50.61 
 
 		 585 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.74 
 
 		 539 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  44.78 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  47.56 
 
 		 510 aa  402  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  46.28 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  48.41 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  45.7 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.19 
 
 		 522 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  43.3 
 
 		 564 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  40.41 
 
 		 592 aa  300  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  40.78 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  48.49 
 
 		 286 aa  237  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.73 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  46.93 
 
 		 308 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  49.2 
 
 		 312 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  45 
 
 		 288 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  47.6 
 
 		 293 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  49.83 
 
 		 288 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  44.65 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.51 
 
 		 285 aa  210  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  48.01 
 
 		 285 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  45.76 
 
 		 288 aa  203  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  43.93 
 
 		 282 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  43.17 
 
 		 298 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  32.51 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  46.69 
 
 		 298 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  43.23 
 
 		 292 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.52 
 
 		 549 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  43.23 
 
 		 292 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  43.23 
 
 		 292 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.95 
 
 		 233 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  49.77 
 
 		 235 aa  193  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  44.33 
 
 		 311 aa  193  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 221 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 221 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 221 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  42.24 
 
 		 300 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  46.9 
 
 		 282 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  44.57 
 
 		 312 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  50.74 
 
 		 204 aa  187  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  44.41 
 
 		 314 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  52.91 
 
 		 205 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  33.14 
 
 		 499 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  49.26 
 
 		 203 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  47.4 
 
 		 201 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  47.76 
 
 		 203 aa  171  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.47 
 
 		 309 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  50.24 
 
 		 203 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.21 
 
 		 350 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  44.61 
 
 		 217 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.95 
 
 		 350 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.34 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  47.76 
 
 		 212 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 		 349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  35.71 
 
 		 350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.21 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  37.06 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.06 
 
 		 353 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  46.19 
 
 		 204 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.21 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.21 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.21 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.21 
 
 		 310 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35.88 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.83 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.57 
 
 		 329 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  35.88 
 
 		 310 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  37.11 
 
 		 339 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  36.72 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 		 355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  34.92 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.17 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.53 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.53 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.53 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.53 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.53 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  37.34 
 
 		 344 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  38.16 
 
 		 301 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.42 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 354 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  45.77 
 
 		 200 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  34.98 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  32.91 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.25 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  33.22 
 
 		 316 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  33.22 
 
 		 316 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  33.04 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  33.04 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>