258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0736 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  99.54 
 
 
218 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  99.54 
 
 
218 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  99.54 
 
 
218 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  99.08 
 
 
218 aa  433  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  99.54 
 
 
218 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  99.54 
 
 
218 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  99.08 
 
 
218 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  99.08 
 
 
218 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  86.24 
 
 
218 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  86.24 
 
 
218 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  86.24 
 
 
218 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  86.24 
 
 
218 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  85.78 
 
 
218 aa  380  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  72.48 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  72.48 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  73.85 
 
 
218 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  71.56 
 
 
218 aa  318  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  69.41 
 
 
219 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  66.06 
 
 
218 aa  299  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  66.06 
 
 
218 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  55.45 
 
 
218 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  54.5 
 
 
218 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  54.5 
 
 
256 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  54.5 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  54.5 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  54.98 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  54.03 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  54.03 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  54.5 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  54.5 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  54.5 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  54.5 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  54.03 
 
 
218 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  54.03 
 
 
218 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  53.55 
 
 
218 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  54.5 
 
 
217 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  52.88 
 
 
215 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  53.17 
 
 
215 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  56.4 
 
 
217 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  54.33 
 
 
215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  52.88 
 
 
215 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  54.25 
 
 
216 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  52.83 
 
 
216 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  54.5 
 
 
228 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  54.5 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  49.53 
 
 
226 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  48.11 
 
 
222 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  48.36 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  45.89 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  48.8 
 
 
215 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  45.62 
 
 
228 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  46.12 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  43.32 
 
 
246 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  44.88 
 
 
222 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  43.63 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  44.17 
 
 
223 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  39.19 
 
 
229 aa  165  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  44.39 
 
 
233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  42.65 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  45.02 
 
 
221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  37.56 
 
 
237 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.46 
 
 
237 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 
235 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  39.34 
 
 
235 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  37.56 
 
 
237 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  37.56 
 
 
237 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  40.38 
 
 
236 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.56 
 
 
237 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  38.01 
 
 
237 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  37.56 
 
 
237 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 
237 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  38.01 
 
 
237 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  40.83 
 
 
242 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  40.18 
 
 
233 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.12 
 
 
237 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  49.15 
 
 
230 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  38.94 
 
 
221 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  35.48 
 
 
243 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  41.59 
 
 
240 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  42.05 
 
 
249 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  45.03 
 
 
218 aa  151  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  36.15 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  36.15 
 
 
234 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  40.99 
 
 
240 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  35.51 
 
 
243 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  46.2 
 
 
257 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2274  Allophanate hydrolase subunit 1  44.98 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  36.94 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  41.15 
 
 
239 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  43.96 
 
 
253 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  41.06 
 
 
201 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  41.4 
 
 
244 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  42.08 
 
 
506 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  45.71 
 
 
203 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  40.89 
 
 
499 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  53.62 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>