More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
592 aa  1111    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  40.92 
 
 
549 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  40.75 
 
 
555 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  39.6 
 
 
562 aa  316  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  43.08 
 
 
518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  40.14 
 
 
553 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  38.15 
 
 
522 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  40.59 
 
 
539 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  38.49 
 
 
534 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  38.82 
 
 
536 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  37.68 
 
 
539 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  39.23 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  41.04 
 
 
585 aa  283  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  41.14 
 
 
539 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  36.85 
 
 
541 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  42.8 
 
 
510 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 
571 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  36.35 
 
 
564 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  47.71 
 
 
282 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  44.37 
 
 
290 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  45.28 
 
 
292 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  45.28 
 
 
292 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  45.28 
 
 
292 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  42.17 
 
 
298 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  47.25 
 
 
312 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  40.84 
 
 
300 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  28.17 
 
 
549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.95 
 
 
285 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  43.79 
 
 
286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  42.07 
 
 
314 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  41.37 
 
 
288 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 
203 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  42.34 
 
 
205 aa  161  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  41.26 
 
 
201 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  42.99 
 
 
203 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  43.69 
 
 
308 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  46.36 
 
 
312 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  38.85 
 
 
288 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  42.45 
 
 
293 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  44.48 
 
 
298 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  44.4 
 
 
235 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  42.95 
 
 
311 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  32.69 
 
 
506 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  40.96 
 
 
325 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  32.6 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  43.44 
 
 
204 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  42.12 
 
 
285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  41.67 
 
 
203 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  40.64 
 
 
204 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  44.73 
 
 
288 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
221 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
221 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
221 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  40.18 
 
 
233 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  43.38 
 
 
282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  39.53 
 
 
248 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  41.07 
 
 
209 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  38.79 
 
 
215 aa  134  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  39.01 
 
 
212 aa  130  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  39.15 
 
 
219 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  38.36 
 
 
215 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  44.69 
 
 
203 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  30.79 
 
 
334 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 
336 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 
215 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.47 
 
 
355 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.47 
 
 
355 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.47 
 
 
355 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  33.97 
 
 
320 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
359 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
371 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.81 
 
 
359 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
359 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
371 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
371 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  36.81 
 
 
371 aa  124  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1802  allophanate hydrolase subunit 2  40.31 
 
 
324 aa  123  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.560779  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  36.68 
 
 
345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36 
 
 
356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  37.16 
 
 
217 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2812  allophanate hydrolase subunit 2  39.62 
 
 
302 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.92 
 
 
355 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  38.76 
 
 
334 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.82 
 
 
323 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 
355 aa  120  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  37.42 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  37.76 
 
 
229 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  31.87 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  36.6 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  31.73 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  34.37 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  36.25 
 
 
344 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
222 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  42.64 
 
 
247 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  36.01 
 
 
335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 
289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  35.69 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  33.73 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  36.17 
 
 
216 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>