More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0175 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  100 
 
 
562 aa  1100    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  74.44 
 
 
555 aa  773    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  49.65 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  50.19 
 
 
531 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.22 
 
 
549 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  48.52 
 
 
539 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  46.42 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.05 
 
 
553 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  49.72 
 
 
518 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  45.71 
 
 
541 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.35 
 
 
539 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  49.01 
 
 
510 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  45.69 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  43.87 
 
 
522 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  44.38 
 
 
539 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  40.85 
 
 
564 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  39.36 
 
 
592 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 
571 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.98 
 
 
290 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  49.5 
 
 
312 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  46.67 
 
 
286 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  46.69 
 
 
288 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  47.68 
 
 
308 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.72 
 
 
285 aa  223  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  46.41 
 
 
293 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  45.06 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  44.73 
 
 
298 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  44.76 
 
 
288 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  43.37 
 
 
292 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  43.37 
 
 
292 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  43.37 
 
 
292 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  45.63 
 
 
288 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  46.08 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  46.76 
 
 
282 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  33.33 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34.26 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  44.34 
 
 
300 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.95 
 
 
549 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  52.48 
 
 
233 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  46.15 
 
 
298 aa  193  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  43.45 
 
 
314 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  51.26 
 
 
221 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  51.26 
 
 
221 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  51.26 
 
 
221 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  52.26 
 
 
235 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  51.83 
 
 
205 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  41.06 
 
 
282 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  51.26 
 
 
203 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  48.77 
 
 
204 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  42.76 
 
 
312 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
311 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  51.24 
 
 
203 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  48.72 
 
 
201 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  47.5 
 
 
204 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  47.72 
 
 
203 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  38.78 
 
 
339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  36.99 
 
 
339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  36.51 
 
 
309 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  36.04 
 
 
332 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  44.67 
 
 
217 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  46.5 
 
 
212 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  46.57 
 
 
200 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
349 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
348 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  35.78 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  33.03 
 
 
350 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  35.39 
 
 
323 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.08 
 
 
310 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.33 
 
 
209 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  32.11 
 
 
350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.28 
 
 
310 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  32.42 
 
 
350 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  34.42 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  34.29 
 
 
345 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 
306 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  32.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  33.77 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  33.77 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  35.06 
 
 
309 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  33.77 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  33.77 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 
355 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  33.77 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  33.74 
 
 
359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
371 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
371 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
371 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  33.74 
 
 
371 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  42.13 
 
 
248 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  30.18 
 
 
334 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>