286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6834 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  100 
 
 
285 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  51.42 
 
 
288 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  56.12 
 
 
312 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  54.77 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  51.59 
 
 
308 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  54.26 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  52.25 
 
 
286 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  49.13 
 
 
292 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  49.13 
 
 
292 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  49.13 
 
 
292 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  50.35 
 
 
290 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  48.01 
 
 
555 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  47.93 
 
 
300 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  48.62 
 
 
298 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  47.35 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.08 
 
 
562 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
539 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  51.88 
 
 
312 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  45.89 
 
 
534 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  48.97 
 
 
549 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.41 
 
 
285 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  46.18 
 
 
539 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  47.95 
 
 
553 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  49.31 
 
 
288 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  47.93 
 
 
314 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  53.19 
 
 
298 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  46.88 
 
 
510 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  45.86 
 
 
531 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  45.89 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  44.37 
 
 
536 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  47.02 
 
 
564 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  45.73 
 
 
541 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  42.66 
 
 
539 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  44.6 
 
 
309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  46.83 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 
518 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  42.21 
 
 
314 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  42.55 
 
 
522 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  48.38 
 
 
282 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  42.86 
 
 
316 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  42.86 
 
 
316 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
310 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  42.51 
 
 
316 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  44.41 
 
 
571 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  43.21 
 
 
309 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.56 
 
 
343 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  36.21 
 
 
311 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.68 
 
 
585 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.15 
 
 
334 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  40.13 
 
 
348 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  40.13 
 
 
349 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.93 
 
 
310 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  41.48 
 
 
592 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.74 
 
 
312 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  37.29 
 
 
332 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  39.8 
 
 
309 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.31 
 
 
350 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  38.46 
 
 
317 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  39.16 
 
 
355 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  40.83 
 
 
354 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.91 
 
 
323 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 
354 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  35.21 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  37.34 
 
 
350 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  36.3 
 
 
328 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  40.67 
 
 
332 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  37.02 
 
 
335 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.87 
 
 
353 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  36.46 
 
 
335 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.4 
 
 
330 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  34.45 
 
 
318 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 
315 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.95 
 
 
344 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.74 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  33.91 
 
 
309 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.02 
 
 
349 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.98 
 
 
339 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  38.78 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  35.14 
 
 
1208 aa  145  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  36.82 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  35.81 
 
 
331 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  37.82 
 
 
355 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  35.41 
 
 
1822 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  43.12 
 
 
289 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 
310 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  35.4 
 
 
336 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  35.9 
 
 
371 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  38.89 
 
 
310 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>