273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0377 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
233 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  76.92 
 
 
235 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  74.76 
 
 
221 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  74.76 
 
 
221 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  74.76 
 
 
221 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  58.33 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  48.66 
 
 
555 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  52.48 
 
 
562 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.72 
 
 
205 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  52.48 
 
 
204 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  51.49 
 
 
201 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  53.03 
 
 
212 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  50.25 
 
 
518 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  49.74 
 
 
541 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.59 
 
 
522 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  53.54 
 
 
539 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  49.5 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  47.66 
 
 
531 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  47.6 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48 
 
 
553 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.69 
 
 
549 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  49.49 
 
 
536 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  47.12 
 
 
204 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  47 
 
 
534 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.45 
 
 
539 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  46.52 
 
 
564 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  45.26 
 
 
248 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 
200 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.06 
 
 
209 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  48.56 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  63.64 
 
 
510 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  45.15 
 
 
539 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  52.66 
 
 
222 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 
571 aa  141  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  44.5 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  42.47 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  47.54 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  44.88 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  42.33 
 
 
592 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  41.59 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  41.4 
 
 
215 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  43.93 
 
 
218 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  43.93 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  41.15 
 
 
218 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  37.68 
 
 
229 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  39.53 
 
 
215 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  41.98 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  42.45 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  42.45 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.45 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.45 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  42.45 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  42.45 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.45 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  42.99 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.26 
 
 
585 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  56.45 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  42.99 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  42.99 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  31.92 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  31.92 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  42.52 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  38.39 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  37.8 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  43.68 
 
 
233 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.4 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  41.15 
 
 
218 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  54.03 
 
 
218 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  53.08 
 
 
217 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  38.39 
 
 
218 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  41.51 
 
 
217 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  41.2 
 
 
216 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  48.44 
 
 
231 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  41.51 
 
 
217 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  38.39 
 
 
218 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  37.91 
 
 
218 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  35.65 
 
 
240 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  50.39 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  38.86 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  39.9 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  41.2 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  46.15 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.18 
 
 
238 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  46.62 
 
 
226 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  48.12 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  47.37 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  37.21 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  48.12 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>