270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2903 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  81.57 
 
 
217 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  81.57 
 
 
217 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  72.81 
 
 
256 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  72.81 
 
 
256 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  72.22 
 
 
259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  72.81 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  72.35 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  73.27 
 
 
218 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  73.27 
 
 
218 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  73.27 
 
 
218 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  73.27 
 
 
218 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  72.35 
 
 
218 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  321  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  71.89 
 
 
218 aa  320  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  60.47 
 
 
215 aa  270  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  60.47 
 
 
215 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  59.53 
 
 
215 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  62.86 
 
 
216 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  59.91 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  60.19 
 
 
216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  57.82 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  56.67 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  57.82 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  57.82 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  57.82 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  57.35 
 
 
218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  55.45 
 
 
218 aa  241  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  56.19 
 
 
218 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  55.92 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  56.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  56.4 
 
 
218 aa  237  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  56.6 
 
 
219 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  55.92 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  53.81 
 
 
218 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  53.81 
 
 
218 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  52.38 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  49.52 
 
 
231 aa  209  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  51.44 
 
 
215 aa  208  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  49.76 
 
 
228 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  48.08 
 
 
217 aa  204  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  53.14 
 
 
221 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  48.1 
 
 
222 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  48.04 
 
 
222 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  49.3 
 
 
226 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  49.05 
 
 
229 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  45.67 
 
 
223 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  43.69 
 
 
236 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  50.78 
 
 
220 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  43.48 
 
 
235 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  42.58 
 
 
235 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  48.36 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 
246 aa  174  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  45.05 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  44.33 
 
 
221 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  46.99 
 
 
242 aa  168  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
243 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  41.12 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  47.14 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  41.12 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  40.65 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  42.61 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.14 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  42.61 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  40.19 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  40.65 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  51.41 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  40.19 
 
 
237 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  40.19 
 
 
237 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  40.19 
 
 
237 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  40.19 
 
 
237 aa  160  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  42.08 
 
 
229 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  43.9 
 
 
242 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.99 
 
 
237 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  43.87 
 
 
240 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  48.82 
 
 
233 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  40.64 
 
 
243 aa  157  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  43.48 
 
 
541 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  41.2 
 
 
233 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  46.19 
 
 
241 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  47.19 
 
 
253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  44.81 
 
 
204 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2274  Allophanate hydrolase subunit 1  46.77 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  50.89 
 
 
257 aa  151  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  44.44 
 
 
518 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  41.9 
 
 
227 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  45.24 
 
 
531 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>