280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0010 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 226 aa  463  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  59.38 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  51.89 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  53 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  53 
 
 		 256 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  53 
 
 		 256 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  53.02 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  52.78 
 
 		 259 aa  207  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  51.17 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  53.02 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  53.02 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  53.02 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  50.7 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  52.13 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  52.61 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  51.17 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  52.11 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  49.77 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  49.77 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  50.7 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  50.7 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  47.91 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  50.47 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  49.3 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  49.3 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  48.37 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  48.37 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  49.3 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  48.37 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  49.53 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  49.3 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  49.06 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  49.54 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  49.29 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  49.29 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  48.72 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  48.37 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  46.67 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  46.48 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  46.6 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  49.3 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  45.81 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  38.03 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  38.03 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.03 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  39.15 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  38.03 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.03 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  38.79 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.7 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.57 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  38.03 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  38.39 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  38.67 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  38.99 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  37.05 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  38.67 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  42.05 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  37.96 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.33 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  37.91 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  52.05 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  46.56 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  54.48 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  37.91 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  37.74 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  34.07 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  45.58 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  45.58 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  38.54 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  51.11 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  36.36 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  44.69 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  51.88 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  46.86 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  50.66 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  42.44 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  39.13 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.62 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  40.28 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  43.02 
 
 		 553 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  50.76 
 
 		 239 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  44.07 
 
 		 539 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  49.61 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  46.97 
 
 		 564 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  43.43 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>