225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0899 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  55.07 
 
 
218 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  55.56 
 
 
218 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  55.56 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  55.07 
 
 
218 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  55.07 
 
 
218 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  53.62 
 
 
218 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  53.62 
 
 
218 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  52.17 
 
 
256 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  52.17 
 
 
256 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  52.17 
 
 
218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  52.17 
 
 
218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  52.17 
 
 
218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  52.17 
 
 
218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  51.69 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  52.17 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  51.69 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  49.76 
 
 
215 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  53.14 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  51.2 
 
 
216 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  47.89 
 
 
218 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  46.92 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2274  Allophanate hydrolase subunit 1  54.07 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  48.33 
 
 
215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  48.83 
 
 
216 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  48.31 
 
 
215 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  47.89 
 
 
215 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  51.69 
 
 
217 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  44.55 
 
 
218 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  43.78 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  44.02 
 
 
222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  43.19 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  44.91 
 
 
218 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  44.91 
 
 
218 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  44.91 
 
 
218 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  44.91 
 
 
218 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  45.33 
 
 
218 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  44.44 
 
 
218 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  43.87 
 
 
219 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 
218 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 
228 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  46.05 
 
 
229 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  43.2 
 
 
223 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  43 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  44.86 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  44.86 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  44.86 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  40.83 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  45.02 
 
 
218 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  43.69 
 
 
229 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  43.93 
 
 
218 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  43.93 
 
 
218 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  43.6 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  46.61 
 
 
241 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 
218 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  44.8 
 
 
241 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  48.4 
 
 
220 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  45.7 
 
 
241 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  45.02 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  41.31 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  38.76 
 
 
221 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  40.57 
 
 
228 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  43.93 
 
 
225 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  41.45 
 
 
217 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  43.46 
 
 
225 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  46.56 
 
 
226 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  45.41 
 
 
244 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  43.19 
 
 
243 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  42.2 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.45 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  38.71 
 
 
242 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  34.91 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  35 
 
 
237 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  34.05 
 
 
237 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.36 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  38.07 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  34.55 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.19 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  39.07 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  40.85 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  39.23 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  56.69 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  35 
 
 
233 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.64 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  39.81 
 
 
230 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  41.84 
 
 
506 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  42.45 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  30.84 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  39.23 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  53.42 
 
 
257 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  35.19 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>