211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4554 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
235 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  91.91 
 
 
235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  68.47 
 
 
236 aa  328  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  59.43 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  41.71 
 
 
223 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  41.95 
 
 
222 aa  184  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  41.51 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  41.4 
 
 
218 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  41.4 
 
 
218 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  40.93 
 
 
218 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  41.4 
 
 
218 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
218 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  42.06 
 
 
217 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  41.31 
 
 
218 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
218 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  40.85 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 
218 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  43.19 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  40.09 
 
 
218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  40.09 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  40.09 
 
 
218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  40.09 
 
 
218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.09 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.09 
 
 
218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  39.91 
 
 
218 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  39.62 
 
 
259 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  41.06 
 
 
215 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  39.44 
 
 
218 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  39.44 
 
 
218 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  39.44 
 
 
218 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  39.44 
 
 
218 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  39.62 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  42.58 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  38.32 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  38.84 
 
 
228 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  40.48 
 
 
216 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  38.97 
 
 
218 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  38.97 
 
 
218 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  37.62 
 
 
215 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  37.62 
 
 
215 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 
218 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  38.03 
 
 
218 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  35.68 
 
 
218 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  41.86 
 
 
217 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  37.91 
 
 
215 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  37.73 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  38.5 
 
 
218 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  38.5 
 
 
218 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  37.96 
 
 
226 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2274  Allophanate hydrolase subunit 1  41.55 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  39.22 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  36.71 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  35.81 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  36.79 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  36.7 
 
 
231 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  38.2 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  37.02 
 
 
506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.74 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.74 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.74 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  34.27 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  32.59 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32.56 
 
 
229 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 
244 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.44 
 
 
225 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  31.67 
 
 
239 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.78 
 
 
237 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  31.25 
 
 
237 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.86 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  31.88 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  36.65 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  44.09 
 
 
233 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.06 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  33.64 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  31.28 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.69 
 
 
242 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  37.08 
 
 
257 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  37.43 
 
 
238 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  36.84 
 
 
231 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  35.27 
 
 
499 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  33.81 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  36.63 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  35.79 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  36.9 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  36.63 
 
 
229 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  35.5 
 
 
239 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  36.63 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  36.26 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  35.26 
 
 
234 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>