More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3520 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
510 aa  971    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  49.01 
 
 
562 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 
555 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  48.17 
 
 
531 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  47.06 
 
 
539 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  43.76 
 
 
549 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  44.79 
 
 
553 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  45.02 
 
 
534 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  48.99 
 
 
518 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.55 
 
 
585 aa  346  7e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  43.76 
 
 
541 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.17 
 
 
539 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  44.74 
 
 
539 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  48.54 
 
 
536 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  43.27 
 
 
522 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  42.02 
 
 
592 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  41.88 
 
 
564 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  40 
 
 
571 aa  236  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  50 
 
 
293 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.12 
 
 
285 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  44.91 
 
 
308 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  33.8 
 
 
506 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  47.55 
 
 
312 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.99 
 
 
290 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  44.95 
 
 
288 aa  193  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  46.21 
 
 
288 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  47.55 
 
 
298 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  36.61 
 
 
499 aa  187  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  46.88 
 
 
285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  43.43 
 
 
298 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  28.43 
 
 
549 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 
282 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  42.56 
 
 
292 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  42.56 
 
 
292 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  42.56 
 
 
292 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  44.03 
 
 
282 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  41.74 
 
 
325 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  43.31 
 
 
286 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  42.66 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  41.78 
 
 
339 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  40.14 
 
 
300 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.5 
 
 
312 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.56 
 
 
205 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  46.98 
 
 
311 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.06 
 
 
309 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.93 
 
 
353 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  61.83 
 
 
233 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  51.89 
 
 
235 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  40.33 
 
 
350 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  39.02 
 
 
350 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  46.93 
 
 
201 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
348 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  41.86 
 
 
314 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
349 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  64.71 
 
 
221 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  64.71 
 
 
221 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  64.71 
 
 
221 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  40.59 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  35.67 
 
 
311 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.37 
 
 
309 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.29 
 
 
310 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  56.03 
 
 
204 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 
350 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  34.95 
 
 
310 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  34.95 
 
 
310 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  34.95 
 
 
310 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  34.95 
 
 
310 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  34.95 
 
 
316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.07 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.95 
 
 
316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  46.53 
 
 
204 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  34.95 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.79 
 
 
312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.95 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  57.6 
 
 
203 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  59.52 
 
 
209 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.15 
 
 
310 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  45.85 
 
 
217 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.48 
 
 
310 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  34.48 
 
 
310 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  38.44 
 
 
355 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  58.02 
 
 
248 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  34.48 
 
 
310 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  34.48 
 
 
310 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  34.48 
 
 
310 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
359 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.03 
 
 
359 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
359 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
371 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
371 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
371 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.03 
 
 
371 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  47.69 
 
 
203 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  54.2 
 
 
203 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.66 
 
 
355 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.24 
 
 
314 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  34.68 
 
 
329 aa  140  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>