286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2196 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  100 
 
 
293 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  58.78 
 
 
290 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  61.37 
 
 
285 aa  285  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  59.93 
 
 
312 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  60.65 
 
 
282 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  55.2 
 
 
308 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  55.71 
 
 
286 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  50.71 
 
 
288 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  56.23 
 
 
298 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  48.77 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  49.3 
 
 
298 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  49.12 
 
 
292 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  49.12 
 
 
292 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  49.12 
 
 
292 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  47.62 
 
 
325 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  53.5 
 
 
288 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  51.38 
 
 
539 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
510 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.41 
 
 
562 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  50 
 
 
288 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  47.28 
 
 
534 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  54.77 
 
 
285 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.6 
 
 
555 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  48.44 
 
 
549 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  49.67 
 
 
553 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  51.85 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  50 
 
 
531 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  46.9 
 
 
541 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.55 
 
 
539 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  52.14 
 
 
312 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  46.9 
 
 
536 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  48.25 
 
 
314 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.16 
 
 
539 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.44 
 
 
585 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  45.29 
 
 
564 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  46.69 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  45.05 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  45.52 
 
 
522 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  43.11 
 
 
309 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  47.42 
 
 
571 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  49.48 
 
 
518 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  41.7 
 
 
310 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  41.61 
 
 
339 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.7 
 
 
309 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.01 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  39.01 
 
 
316 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  39.68 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.31 
 
 
314 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.65 
 
 
316 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  41.04 
 
 
350 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  41.04 
 
 
350 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  40.06 
 
 
359 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  40.06 
 
 
359 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  40.06 
 
 
359 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  39.69 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  39.69 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  39.69 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  38.25 
 
 
310 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  39.69 
 
 
371 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.25 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.25 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.25 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.25 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.25 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  38.65 
 
 
310 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.98 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  37.98 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.98 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.98 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  42.36 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.98 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  40.58 
 
 
355 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  38.25 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  38.3 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  41.2 
 
 
349 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  41.2 
 
 
348 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.86 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.21 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 
356 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.74 
 
 
356 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  43.48 
 
 
330 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
355 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
355 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
355 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  40 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  41.69 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  40.99 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.09 
 
 
307 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
310 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.91 
 
 
334 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  40.94 
 
 
329 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  35.88 
 
 
328 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.72 
 
 
332 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  42.46 
 
 
318 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  36.18 
 
 
332 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.97 
 
 
365 aa  156  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 
331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>