More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1829 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
506 aa  994    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  65.92 
 
 
499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  35.01 
 
 
553 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  30.3 
 
 
549 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  33.86 
 
 
539 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  34.77 
 
 
531 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  33.98 
 
 
549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  34.19 
 
 
534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  33.46 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  32.28 
 
 
539 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  34.19 
 
 
522 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
562 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  31.95 
 
 
555 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  34.01 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  39.2 
 
 
334 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  33.4 
 
 
510 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  33.77 
 
 
585 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  33.48 
 
 
564 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  33.95 
 
 
518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  32.39 
 
 
571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  35.29 
 
 
328 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  34.24 
 
 
315 aa  158  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.23 
 
 
312 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.07 
 
 
330 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.33 
 
 
334 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  48.65 
 
 
225 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  45 
 
 
225 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  42.23 
 
 
219 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  41.06 
 
 
227 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.22 
 
 
343 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 
310 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  45.32 
 
 
229 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  46.84 
 
 
215 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.11 
 
 
246 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.63 
 
 
323 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.59 
 
 
325 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  32.82 
 
 
592 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  41.58 
 
 
218 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  41.58 
 
 
218 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  41.58 
 
 
218 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  32.76 
 
 
321 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  41.58 
 
 
218 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  48.26 
 
 
218 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  45.5 
 
 
218 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  41.09 
 
 
218 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  48.52 
 
 
216 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  40.66 
 
 
339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  45.88 
 
 
218 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  45.88 
 
 
218 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  41.09 
 
 
218 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  34.12 
 
 
307 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  45.88 
 
 
218 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  31.86 
 
 
329 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  42.08 
 
 
218 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  140  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  44.25 
 
 
226 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 
344 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  42.08 
 
 
218 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  36.22 
 
 
221 aa  140  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  45.61 
 
 
218 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  45.61 
 
 
218 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  45.61 
 
 
218 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 
335 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.61 
 
 
218 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  31.93 
 
 
336 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  31.93 
 
 
336 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  35.07 
 
 
389 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.61 
 
 
256 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  45.61 
 
 
256 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  45.88 
 
 
218 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  46.2 
 
 
259 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.43 
 
 
329 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  44.62 
 
 
234 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  38.91 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  44.56 
 
 
215 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  43.92 
 
 
215 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  45.56 
 
 
201 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  32.76 
 
 
311 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  43.39 
 
 
215 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  45.03 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  46.15 
 
 
216 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  44.77 
 
 
218 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  44.77 
 
 
218 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
315 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  37.56 
 
 
242 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.29 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  42.36 
 
 
243 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 
234 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  31.63 
 
 
306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  39.5 
 
 
230 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  31.19 
 
 
329 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  40.49 
 
 
218 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>