286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0098 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  100 
 
 
312 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  88.34 
 
 
311 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  56.27 
 
 
290 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  49.82 
 
 
288 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  53.76 
 
 
286 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  57.91 
 
 
298 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  53.68 
 
 
308 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  51.43 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  55.87 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  51.76 
 
 
285 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  51.49 
 
 
312 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  52.25 
 
 
293 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  50.36 
 
 
549 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  48.44 
 
 
298 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  55 
 
 
282 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.91 
 
 
553 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  46.47 
 
 
539 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  50.9 
 
 
539 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  46.31 
 
 
534 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  50.35 
 
 
282 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  44.68 
 
 
309 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  44.11 
 
 
555 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  46.67 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  44.01 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  46.67 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  46.67 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  45.8 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  43.6 
 
 
323 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  46.74 
 
 
531 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  46.55 
 
 
541 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  41.75 
 
 
350 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  45.96 
 
 
536 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  47.92 
 
 
288 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  42.01 
 
 
562 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  46.23 
 
 
314 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  41.48 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  41.42 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  46.88 
 
 
564 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
371 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
371 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
371 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  43.55 
 
 
314 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  42.86 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
371 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  43.62 
 
 
309 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
349 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  42.91 
 
 
348 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  41.13 
 
 
316 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  41.13 
 
 
316 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  40.78 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  42.55 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  43.18 
 
 
359 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  43.9 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  44.37 
 
 
330 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  42.47 
 
 
339 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.52 
 
 
522 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  43.58 
 
 
353 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 
288 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  47.1 
 
 
289 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  47.5 
 
 
510 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.87 
 
 
334 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  47.77 
 
 
518 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  40.58 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.23 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  41.04 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  41.04 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  40.26 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  41.04 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  43.25 
 
 
332 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  34.9 
 
 
320 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  34.9 
 
 
320 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  38.51 
 
 
328 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  42.61 
 
 
344 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  40.43 
 
 
310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.01 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  35.88 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.01 
 
 
329 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  40.07 
 
 
310 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  44.16 
 
 
571 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  40.07 
 
 
310 aa  170  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  41.23 
 
 
355 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.46 
 
 
328 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  41.69 
 
 
539 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.23 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.56 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  40.38 
 
 
355 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  39.24 
 
 
317 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>