218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10268 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  63.18 
 
 
221 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  63.18 
 
 
221 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  63.18 
 
 
221 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  60.29 
 
 
235 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  58.33 
 
 
233 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  47 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  44.61 
 
 
555 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  46.43 
 
 
204 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  44.67 
 
 
562 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  46.27 
 
 
212 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  41.21 
 
 
205 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  43.28 
 
 
203 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  42.93 
 
 
518 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  39.69 
 
 
541 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  42.13 
 
 
204 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  41.92 
 
 
531 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  40.67 
 
 
522 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  45.45 
 
 
510 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  38.96 
 
 
248 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  40.93 
 
 
553 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  42.35 
 
 
539 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  40 
 
 
549 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  40.8 
 
 
203 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  40.98 
 
 
203 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  40.72 
 
 
539 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  39.29 
 
 
534 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  39.7 
 
 
209 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 
536 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  41.84 
 
 
585 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  38.24 
 
 
539 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 
200 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  40.57 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  45.29 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  37.85 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  38.69 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  39.04 
 
 
592 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  37.85 
 
 
215 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  37.14 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  35.68 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  35.94 
 
 
564 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
571 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  35.1 
 
 
216 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  34.45 
 
 
218 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  34.93 
 
 
216 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  37.85 
 
 
243 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  37.26 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  37.26 
 
 
218 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  37.26 
 
 
218 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  37.86 
 
 
221 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  36.32 
 
 
233 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  36.79 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  38.19 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  36.67 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  37.99 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  32.58 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  33.49 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  36.32 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  35.44 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  35.55 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  33 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  36.89 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  37.37 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  35.56 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  32.54 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  43.55 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  31.25 
 
 
238 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  42.34 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  33.97 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  34.6 
 
 
259 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  32.02 
 
 
239 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  27.54 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  34.47 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.47 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.47 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.47 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  33.68 
 
 
499 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  43.8 
 
 
247 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  28.5 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  40.87 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  31.28 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  32.06 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  44.26 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>