286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1985 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  46.65 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  47.97 
 
 
306 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  46.49 
 
 
310 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  43.3 
 
 
315 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  43.4 
 
 
311 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  41.38 
 
 
312 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  42.11 
 
 
309 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  40.88 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.91 
 
 
318 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  39.48 
 
 
334 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  40.97 
 
 
317 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  41.81 
 
 
305 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  41.81 
 
 
305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  40.13 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  40.94 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  41.61 
 
 
301 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  44.13 
 
 
549 aa  208  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  41.11 
 
 
305 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  38.03 
 
 
327 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.75 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.18 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.39 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  38.22 
 
 
305 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.2 
 
 
329 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.83 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  34.53 
 
 
320 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.53 
 
 
329 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  34.53 
 
 
320 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.42 
 
 
329 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.2 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  37.59 
 
 
339 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  38.67 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  35.67 
 
 
330 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.85 
 
 
329 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  32.25 
 
 
323 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  40.73 
 
 
309 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.44 
 
 
329 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.92 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  38.49 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  35.25 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  37.93 
 
 
339 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  37.17 
 
 
313 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.38 
 
 
359 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
359 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
359 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 
371 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.19 
 
 
359 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  35.1 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  35.1 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  37.21 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  37.41 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  35.2 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  35.29 
 
 
359 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  35.22 
 
 
353 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 
339 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.2 
 
 
356 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  35.76 
 
 
336 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  32.78 
 
 
325 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  35.37 
 
 
349 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  34.71 
 
 
314 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  35.03 
 
 
355 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  35.03 
 
 
355 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.03 
 
 
355 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 
339 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.08 
 
 
314 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  36.52 
 
 
345 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  36.39 
 
 
334 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  34.08 
 
 
355 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  34.63 
 
 
310 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  36.3 
 
 
344 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.19 
 
 
350 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  34.71 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  34.94 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  34.94 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  33.96 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.94 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  34.94 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  36.25 
 
 
347 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.49 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  33.02 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  33.65 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  35.5 
 
 
309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  34.52 
 
 
309 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35.18 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.18 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.18 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  34.68 
 
 
310 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.18 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35.18 
 
 
310 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  37.32 
 
 
298 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35.18 
 
 
310 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  32.99 
 
 
290 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  33.11 
 
 
312 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  33.55 
 
 
350 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.18 
 
 
310 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>