286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4360 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
312 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.19 
 
 
330 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.83 
 
 
323 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
317 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.28 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.35 
 
 
348 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.35 
 
 
349 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 
350 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  38.83 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 
355 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
309 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  38.08 
 
 
355 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 
355 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.28 
 
 
350 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.28 
 
 
350 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.74 
 
 
316 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1955  urea amidolyase related protein  38.91 
 
 
328 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
309 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.82 
 
 
359 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  38.82 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.41 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.17 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  39.27 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  37.35 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  37.35 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.82 
 
 
353 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  36.93 
 
 
314 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.64 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  38.41 
 
 
355 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  39.33 
 
 
359 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  41.86 
 
 
310 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.75 
 
 
329 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.44 
 
 
329 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  32.81 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  36.79 
 
 
304 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  36.14 
 
 
311 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.64 
 
 
329 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  33.13 
 
 
325 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.44 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.43 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.65 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.65 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.01 
 
 
329 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  37.25 
 
 
339 aa  165  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  32.04 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 
345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.75 
 
 
310 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.75 
 
 
310 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.75 
 
 
310 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.75 
 
 
310 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.63 
 
 
310 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0378  urea amidolyase-related protein  32.6 
 
 
334 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
322 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  31.8 
 
 
328 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  35.55 
 
 
304 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.59 
 
 
312 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  35.23 
 
 
309 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.19 
 
 
339 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
326 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  34.03 
 
 
306 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  34.55 
 
 
310 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  38.21 
 
 
310 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  35.78 
 
 
331 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.86 
 
 
310 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  33.55 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0741  hypothetical protein  31.38 
 
 
334 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0758  hypothetical protein  31.38 
 
 
334 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  38.41 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.5 
 
 
310 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  35.29 
 
 
305 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.86 
 
 
310 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 
307 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  36.13 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 
334 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  34.97 
 
 
336 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  33.99 
 
 
319 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  37.34 
 
 
313 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  35.51 
 
 
317 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.54 
 
 
365 aa  149  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 
339 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  35.06 
 
 
305 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  35.2 
 
 
309 aa  149  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  32.9 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  33.89 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  35.46 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  35.26 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  34.41 
 
 
332 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  34.87 
 
 
305 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>