286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  96.49 
 
 		 313 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  63.07 
 
 		 304 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  61.17 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  61.84 
 
 		 305 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  63.33 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  60.2 
 
 		 305 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  60.2 
 
 		 305 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  55.99 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  45.3 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  45.3 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  44.03 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  41.04 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.81 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  41.24 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  47.31 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  38.75 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  41.76 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.62 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  46.05 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  39.44 
 
 		 549 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  40.42 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  46.04 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  41.46 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  32.54 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.83 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.83 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.14 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.77 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.79 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.27 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  41.1 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.58 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  36.05 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  37.34 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.63 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.67 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  36.01 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  35.98 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  31.33 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  33.92 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.12 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  33.9 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.33 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.86 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.86 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.36 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.36 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.48 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  37.84 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  36.93 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.3 
 
 		 389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  36.36 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.2 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  31.76 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  34.67 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  37.28 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  37.07 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  34.67 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.6 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  35.74 
 
 		 359 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  35.74 
 
 		 359 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  35.11 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  35.85 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.85 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  35.11 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  35.69 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  35.11 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.31 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  35.11 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  33.79 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  33.79 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  34.28 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.23 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  34.28 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  34.28 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  35.33 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  33.79 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  30.77 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  33.89 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  30.1 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  33.79 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  35.11 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  35.56 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  35.74 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.46 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>