286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58515 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  88.03 
 
 
309 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  65.56 
 
 
301 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  41.9 
 
 
315 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  44.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  41.18 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  40.26 
 
 
306 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  40.73 
 
 
322 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  40.41 
 
 
312 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  45.91 
 
 
304 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  40.94 
 
 
307 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.14 
 
 
318 aa  202  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  44.14 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  44.14 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  43.79 
 
 
305 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  45.65 
 
 
305 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  44.77 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  46.01 
 
 
313 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 
310 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  45.25 
 
 
313 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  41.84 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  37.79 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  41.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  40.24 
 
 
355 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  40.24 
 
 
355 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  40.24 
 
 
355 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  47.54 
 
 
305 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  39.82 
 
 
355 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  36.77 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.28 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.51 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  41.98 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.28 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  40.71 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.67 
 
 
350 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  39.74 
 
 
339 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.67 
 
 
310 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
371 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.94 
 
 
359 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  40.84 
 
 
355 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
359 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
359 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
371 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
371 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  38.94 
 
 
371 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.48 
 
 
310 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.7 
 
 
310 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.33 
 
 
310 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.33 
 
 
310 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.33 
 
 
310 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.33 
 
 
310 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.33 
 
 
310 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.23 
 
 
334 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.36 
 
 
310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.33 
 
 
310 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  39.18 
 
 
339 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  36.45 
 
 
328 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  39.3 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.99 
 
 
310 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.91 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.91 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  39.53 
 
 
339 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  38.91 
 
 
359 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  36.3 
 
 
549 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  36.13 
 
 
317 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 
316 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  37.71 
 
 
310 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.5 
 
 
316 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.5 
 
 
316 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  39.72 
 
 
335 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.54 
 
 
353 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 
309 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.99 
 
 
310 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 
309 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.76 
 
 
354 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  40.89 
 
 
317 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 
354 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  35.06 
 
 
329 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  37.13 
 
 
332 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  39.86 
 
 
336 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  38.14 
 
 
359 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.88 
 
 
314 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.83 
 
 
329 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  40 
 
 
339 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
332 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  35.74 
 
 
309 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  32.15 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.12 
 
 
320 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.12 
 
 
320 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.12 
 
 
329 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  38.06 
 
 
323 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.87 
 
 
323 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  34.55 
 
 
314 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  37.12 
 
 
323 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  38.28 
 
 
345 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.9 
 
 
329 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>