286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01082 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  100 
 
 		 327 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  42.02 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  39.2 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  38.57 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  39 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.61 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  38.03 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  37.91 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  37.59 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  35.82 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  36.52 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  37.72 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  36.52 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  38.95 
 
 		 301 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.1 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.56 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  35.67 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  32.48 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  35.64 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  32.92 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.97 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  35.03 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  32.29 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  32.29 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  32.22 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  31.97 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  31.97 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.35 
 
 		 549 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  32.5 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  33 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  34.81 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.15 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  33.55 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  37.79 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  31.85 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  32.32 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.78 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  30.74 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  30.74 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  30.74 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  34.97 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  30.74 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.22 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  31.08 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  34.19 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  32.66 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  32.66 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  32.66 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  34.19 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  33.89 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  31.56 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  31.56 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  32.14 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  30.98 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  32.5 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  30.41 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  30.41 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  30.07 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  30.07 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  30.07 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  30.07 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  30.41 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  30.41 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  32.37 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  30.16 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  32.37 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  30.72 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.79 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  31.87 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  33.66 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  31.87 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  33.54 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  34.04 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  33.92 
 
 		 313 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  32.77 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  31.55 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  30.3 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  32.23 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  31.55 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  32.88 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  31.55 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  31.76 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  30.23 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  29.35 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  30.97 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  30.48 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  30.6 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  32.05 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  31.55 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>