286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1407 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  72.04 
 
 		 305 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  71.71 
 
 		 305 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  71.38 
 
 		 305 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  72.19 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  64.9 
 
 		 304 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  63.33 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  63.33 
 
 		 313 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  58.88 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  45.8 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  44.2 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  41.21 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  44.93 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  44.06 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  42.86 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  40.88 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  40.75 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  45.42 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  41.76 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  37.91 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  44.95 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  37.76 
 
 		 549 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  42.52 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  36.61 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.26 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  41.88 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  36.79 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.7 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  35.58 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.14 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.3 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  41.69 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  36.31 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.05 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  32.88 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.67 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.15 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.15 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.15 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.33 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.15 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.15 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  37.32 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.14 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  31.67 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  35.74 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  31.93 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  33.45 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  40.52 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  31.42 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  37.21 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  35.67 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.91 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.24 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  39.3 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  30.69 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.24 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.67 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  35.23 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.54 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.23 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  35.23 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  36.07 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  36.93 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  35.92 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.55 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  41.39 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.55 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  31.33 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.33 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.06 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  30.69 
 
 		 320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  30.69 
 
 		 320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.05 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.06 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.06 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.06 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  30.69 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  30.36 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  36.73 
 
 		 355 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  33.74 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  30.69 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.46 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  30.49 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  33.88 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  33.77 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  34.45 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  31.85 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  33.77 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  32.88 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  33.77 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  33.77 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>