286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  100 
 
 
301 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  67.55 
 
 
309 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  65.56 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  44.04 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  43.52 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  43.37 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  44.7 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  41 
 
 
306 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  49.45 
 
 
305 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  41.97 
 
 
318 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  46.51 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  46.13 
 
 
305 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  41.61 
 
 
322 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  45.79 
 
 
305 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  45.51 
 
 
304 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 
307 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  45.42 
 
 
304 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  39.59 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  47.45 
 
 
313 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  43.4 
 
 
330 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  46.27 
 
 
313 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  43.3 
 
 
339 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  38.95 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.46 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.46 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.15 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  37.59 
 
 
549 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  39.93 
 
 
309 aa  175  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.87 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.87 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.87 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.87 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.87 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.58 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  41.75 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  41.39 
 
 
309 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  40.07 
 
 
310 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 
310 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.34 
 
 
353 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  42.33 
 
 
339 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.52 
 
 
328 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  41.41 
 
 
317 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
323 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.56 
 
 
310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.56 
 
 
310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.56 
 
 
310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.56 
 
 
310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  39.1 
 
 
323 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.6 
 
 
310 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  41.38 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  39.37 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  39.07 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  36.81 
 
 
307 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  39.38 
 
 
310 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  38.1 
 
 
323 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
329 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.77 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  40.19 
 
 
332 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.77 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.88 
 
 
329 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 
310 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  36.42 
 
 
317 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  36.42 
 
 
349 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.22 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  37.38 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.58 
 
 
316 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  37.38 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.58 
 
 
316 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 
316 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  39.03 
 
 
355 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  39.03 
 
 
355 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  39.03 
 
 
355 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 
315 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  37.38 
 
 
306 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.77 
 
 
329 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.77 
 
 
329 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  38.18 
 
 
310 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  41.25 
 
 
305 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.33 
 
 
323 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.01 
 
 
365 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.22 
 
 
329 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.55 
 
 
329 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  40 
 
 
345 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.11 
 
 
320 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.39 
 
 
359 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.11 
 
 
320 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
359 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  34.78 
 
 
325 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
359 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.95 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
371 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.43 
 
 
323 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  37.05 
 
 
306 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
371 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  36.96 
 
 
323 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
371 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  38.39 
 
 
371 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>