286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3380 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  64.9 
 
 		 304 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  61.13 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  61.13 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  60.93 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  59.93 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  63.07 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  61.44 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  61.76 
 
 		 313 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  43.83 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  42.96 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  41.45 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  39.73 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  40.91 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  41.14 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  40.13 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  42.81 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  45.51 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  40.67 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  38.03 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  37.66 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.16 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.67 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.82 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.82 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.38 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.82 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.82 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.82 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.82 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.8 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.97 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.84 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.84 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.59 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.59 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.59 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  35.64 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.59 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.67 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  44.77 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  34.85 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  39.54 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  42.71 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  31.17 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.22 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.86 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  40.21 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  36.14 
 
 		 549 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  35.55 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  39.07 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  39.67 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  36.16 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  35.97 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  32.48 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.55 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.12 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  31.96 
 
 		 365 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  40.26 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  42.14 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  32.48 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  32.48 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  33.01 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.18 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  32.48 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  32.48 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  31.83 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  31.85 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.13 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  30.45 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.4 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  30.45 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  36.05 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  37.04 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  31.9 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  32.15 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  35.87 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.02 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  32.18 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  36.59 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.39 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.39 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.39 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0378  urea amidolyase-related protein  29.35 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.39 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.39 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>