286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1105 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 339 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  83.33 
 
 		 359 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  68.07 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  61.9 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  54.71 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  50.44 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  49.86 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  45.51 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  45.8 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  46.38 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  41.49 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  43.11 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  41.94 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  44.16 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  42.05 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  43.02 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  41.76 
 
 		 354 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  43.19 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  44.93 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  40.78 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.72 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  39.06 
 
 		 389 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  41.95 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  41.86 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.87 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.87 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  43.3 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  35.57 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.49 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  40.78 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.99 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.66 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.66 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.66 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  33.12 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  33.12 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.66 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.66 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.81 
 
 		 365 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.65 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.66 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.07 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  37.18 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.18 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  37.18 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.18 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.27 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.66 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.66 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.67 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  32.91 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  34.43 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.91 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  32.59 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  40.47 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.86 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  32.59 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  37.61 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.03 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  35.99 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  37.41 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.76 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  35.43 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  37.07 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  39.05 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  36.55 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  39.53 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.57 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  39 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.54 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  34.89 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  35.83 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.23 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  39.24 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  35.67 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  37.43 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.86 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.42 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  33.98 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  35.39 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.52 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.39 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.55 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  31.6 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  30.74 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>