286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2812 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2812  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  43.49 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  43.49 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  43.15 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  43.57 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  43.37 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  42.95 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  42.03 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  41.38 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  43.45 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  41.19 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  41.19 
 
 		 349 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.19 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  41.88 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  39.02 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  35.6 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.28 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.03 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.03 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.03 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  40.66 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.67 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  39.41 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  43 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  41.52 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  41.52 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  41.52 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  41.04 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  41.77 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  36.57 
 
 		 329 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  41.87 
 
 		 310 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.28 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  41.52 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  41.01 
 
 		 1203 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.26 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  41.52 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  44.29 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  39.12 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  41.52 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  42.24 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.44 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  41.8 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  40.69 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  41.83 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  40.69 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.63 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  40.68 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  40.68 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.63 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  40.68 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  40.68 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  40.51 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  40.68 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  40.51 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  40.51 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.36 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  40.69 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  36.68 
 
 		 1212 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  40.69 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  38.71 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  39.73 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.31 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  36.51 
 
 		 1209 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  40.14 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  38.92 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1802  allophanate hydrolase subunit 2  44.52 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.560779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  41.58 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  40.77 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  39.42 
 
 		 1210 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40.32 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  40.97 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  40.76 
 
 		 1233 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  38.1 
 
 		 1209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.76 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  40.32 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  36.88 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  36.08 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  42.4 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  40.32 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  43.9 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  38.29 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.79 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 		 317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  42.29 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.05 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  35.97 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  40.94 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  35.13 
 
 		 1208 aa  162  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  38.22 
 
 		 1207 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>