197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1067 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 593 aa  1114    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 578 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  29.6 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.82 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  30.46 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.34 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.8 
 
 		 547 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.2 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.94 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  21.81 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.03 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.03 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.07 
 
 		 549 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30.78 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  21.36 
 
 		 549 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 		 613 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  21.75 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  19.97 
 
 		 927 aa  100  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  25.32 
 
 		 590 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  46.92 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  25.36 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  51.65 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 		 210 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  42.37 
 
 		 188 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  43 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  41.49 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  21.34 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  31.17 
 
 		 577 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  30.74 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.42 
 
 		 869 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.5 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  41.58 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.21 
 
 		 126 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 226 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.33 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  29.78 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  36.03 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.68 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  36.96 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  39.39 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  39.39 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  34.5 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  40.32 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  33.53 
 
 		 299 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  36.22 
 
 		 130 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 124 aa  62  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.88 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  34.54 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  34.92 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  32 
 
 		 310 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 118 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  34.58 
 
 		 121 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  39.68 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.06 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.29 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  34.03 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  28.15 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  27.15 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.45 
 
 		 233 aa  57  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 126 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.54 
 
 		 210 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0957  copper resistance D domain-containing protein  34.71 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.61 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  25.96 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  29.14 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 588 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  36.36 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 196 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  29.2 
 
 		 172 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  34.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 197 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  25.4 
 
 		 306 aa  54.3  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>