109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3463 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  100 
 
 		 304 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  85.42 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  82.12 
 
 		 277 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  82.12 
 
 		 277 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  82.12 
 
 		 277 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  78.15 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  63.2 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  62.91 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  57.63 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  56.03 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  56.87 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  57.46 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  52.36 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  52.31 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  55.35 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  55 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  53.9 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  49.81 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  53.46 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  52.29 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  52.59 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  52.92 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.85 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  52.87 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  54.37 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  53.23 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  50.54 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  50.78 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  47.44 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  42.8 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  33.85 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 1019 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  30.64 
 
 		 366 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  28.3 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  25.1 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 1052 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.82 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  28.67 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  30.95 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  27.78 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  30.3 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  30.28 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  30.63 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  30.63 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  30.63 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  30.46 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  30.77 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.45 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  26.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 1016 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  28.42 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  31.28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.51 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  28.26 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  27.43 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.47 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.09 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.14 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.22 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 1048 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.73 
 
 		 988 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  33.12 
 
 		 1187 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 915 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  26.85 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.31 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.83 
 
 		 958 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.52 
 
 		 957 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  31.43 
 
 		 1094 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  28.21 
 
 		 960 aa  49.3  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.41 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.37 
 
 		 788 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 781 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.37 
 
 		 788 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.75 
 
 		 788 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 		 1066 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.82 
 
 		 780 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  34.62 
 
 		 1135 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.37 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 1040 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  33.13 
 
 		 991 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  39.13 
 
 		 993 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  25.94 
 
 		 997 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1061 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.02 
 
 		 940 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.89 
 
 		 997 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  25.12 
 
 		 919 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 1038 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 1038 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 1059 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  27.37 
 
 		 1014 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>