137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1235 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  716    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  30.26 
 
 		 460 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  27.98 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.19 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.89 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.77 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.14 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.14 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.71 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.5 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.54 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.22 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  21.56 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.63 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.29 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.08 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  25.52 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.6 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  20.84 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  20.05 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  22.42 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  22.34 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  50 
 
 		 565 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.36 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  25.62 
 
 		 397 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  21.19 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  29.6 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  46.94 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  24.68 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  24.68 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24.24 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  22.48 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.7 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  24.24 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  44.68 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  36 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 		 1201 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.04 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  21.99 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  40.32 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  38.67 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  19.73 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  44.68 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  44.68 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  47.73 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  34.18 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1191 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  34.18 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  34.18 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  34.18 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  39.44 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  51.06 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  47.37 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  33.33 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1130  hypothetical protein  37.66 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.123574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  48.84 
 
 		 571 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  26.49 
 
 		 736 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  43.18 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  37.25 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  48.84 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  52 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  28.36 
 
 		 1188 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  43.64 
 
 		 458 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  38.89 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  25.13 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1385  SMC protein-like protein  46.97 
 
 		 1091 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.82 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  32.18 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  31.03 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  39.68 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  44.68 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  30.95 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.82 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  38.3 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  44.68 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  38.67 
 
 		 1217 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  34.15 
 
 		 1191 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  48.89 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  24.43 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  33.01 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 		 1019 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  44.68 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  43.08 
 
 		 1196 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  42.55 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  34.85 
 
 		 1189 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1189 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1189 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  29.33 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1234 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  48.84 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  21.79 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1173 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  26.87 
 
 		 1198 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  26.87 
 
 		 1198 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  28.07 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>