More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0926 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  52.13 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  52.13 
 
 		 240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  52.8 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  48.25 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  53.23 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  53.27 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  51.24 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  51.4 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  49.48 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  47.89 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 255 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  44.28 
 
 		 258 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  46.08 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.66 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>