More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1253 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 196 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  40.54 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.52 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 290 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>