259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2408 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 		 208 aa  339  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  63.64 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  62.81 
 
 		 203 aa  267  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  63.13 
 
 		 203 aa  267  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  60.8 
 
 		 204 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  59.3 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  59.6 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  62.78 
 
 		 181 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  54.04 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  50.79 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 192 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 194 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  46 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  34.22 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  24.85 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  30.98 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  29.7 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  29.7 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  29.7 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  26.29 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  21.02 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.71 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  37.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  34.04 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  38.96 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.73 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 182 aa  48.5  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  42.65 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  42.65 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  42.65 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  24.52 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.76 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1936  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  35.23 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  40 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  35.23 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>