More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0533 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 518 aa  979    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  52.17 
 
 		 541 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  52.79 
 
 		 553 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  51.24 
 
 		 534 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  50.19 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  52.35 
 
 		 536 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  50.84 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  54.02 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  51.41 
 
 		 531 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  49.72 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  50.1 
 
 		 522 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  51.59 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  48.31 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  48.28 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.56 
 
 		 585 aa  360  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  42.38 
 
 		 592 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  41.74 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  38.57 
 
 		 564 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  47.8 
 
 		 288 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  61.19 
 
 		 203 aa  217  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  52.78 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  47.81 
 
 		 325 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.46 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  48.4 
 
 		 311 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  46.53 
 
 		 286 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  53.96 
 
 		 203 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  49.48 
 
 		 293 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  44.52 
 
 		 298 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34.69 
 
 		 499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  43.85 
 
 		 292 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  43.85 
 
 		 292 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  43.85 
 
 		 292 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  54.15 
 
 		 205 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  47.42 
 
 		 308 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  52.88 
 
 		 201 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  51.75 
 
 		 282 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  29.04 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  52.45 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  52.48 
 
 		 204 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 		 285 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.32 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  33.95 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  44.33 
 
 		 314 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  41.53 
 
 		 300 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  43.99 
 
 		 282 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  49.76 
 
 		 221 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  49.76 
 
 		 221 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  49.76 
 
 		 221 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  50.25 
 
 		 233 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  47.52 
 
 		 204 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  46.67 
 
 		 312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  51.23 
 
 		 203 aa  181  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  45.05 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 		 248 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  41.61 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  45.64 
 
 		 288 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 		 350 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  50.73 
 
 		 200 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  48.11 
 
 		 219 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  44.75 
 
 		 298 aa  163  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.27 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  40.32 
 
 		 353 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.66 
 
 		 350 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.33 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  44.83 
 
 		 212 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.88 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  30.17 
 
 		 343 aa  153  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.76 
 
 		 209 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.21 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  38.99 
 
 		 1201 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 332 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  43.96 
 
 		 217 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  42.93 
 
 		 217 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  47.74 
 
 		 203 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.79 
 
 		 329 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.11 
 
 		 329 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  38.34 
 
 		 1207 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  32.78 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  32.78 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.33 
 
 		 328 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  32.78 
 
 		 329 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  45.89 
 
 		 217 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  37.8 
 
 		 310 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  46.35 
 
 		 216 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  43.48 
 
 		 217 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  44.17 
 
 		 218 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2812  allophanate hydrolase subunit 2  42.76 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.37 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  38.66 
 
 		 1200 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  43 
 
 		 259 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  32.34 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.74 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.74 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.74 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  43.96 
 
 		 218 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  43.96 
 
 		 218 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>