200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1779 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  96.2 
 
 
552 aa  1073  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  100 
 
 
552 aa  1116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  69.49 
 
 
552 aa  773  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  96.56 
 
 
552 aa  1080  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  40 
 
 
606 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  37.31 
 
 
579 aa  353  3e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  38.26 
 
 
558 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  38.26 
 
 
558 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  38.06 
 
 
558 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  40 
 
 
565 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  37.12 
 
 
606 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  37.65 
 
 
603 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  36.38 
 
 
605 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
587 aa  321  2e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  34.11 
 
 
537 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  8.56367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  36.14 
 
 
557 aa  309  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  35.47 
 
 
609 aa  305  2e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  35.34 
 
 
516 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  34.68 
 
 
558 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.17 
 
 
576 aa  132  2e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  33.75 
 
 
869 aa  124  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.49 
 
 
803 aa  123  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  35.34 
 
 
952 aa  122  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.68 
 
 
833 aa  120  8e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.82 
 
 
834 aa  117  7e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
977 aa  112  2e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
849 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.8 
 
 
936 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  23.96 
 
 
824 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.96 
 
 
920 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  35.96 
 
 
948 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  31.72 
 
 
915 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  31.15 
 
 
852 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29 
 
 
779 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 
921 aa  100  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.84 
 
 
910 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  23.39 
 
 
947 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  22.32 
 
 
753 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  31.06 
 
 
828 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30.94 
 
 
919 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  31.08 
 
 
931 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  30 
 
 
919 aa  98.6  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
922 aa  97.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.18 
 
 
781 aa  97.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.64 
 
 
828 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.71 
 
 
827 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.85 
 
 
877 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  29.2 
 
 
897 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  28.35 
 
 
940 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.44 
 
 
912 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.25 
 
 
830 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.36 
 
 
877 aa  94.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.9 
 
 
800 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
1055 aa  93.6  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.9 
 
 
875 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
869 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.96 
 
 
920 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  28.57 
 
 
869 aa  85.5  3e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  28.51 
 
 
830 aa  83.6  8e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
846 aa  83.2  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.66 
 
 
800 aa  82  3e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
388 aa  79.3  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  31.98 
 
 
823 aa  77  7e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
387 aa  77  8e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.44 
 
 
478 aa  76.6  1e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25.8 
 
 
828 aa  76.6  1e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.74 
 
 
837 aa  76.6  1e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.52 
 
 
837 aa  75.5  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.71 
 
 
812 aa  76.3  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.37 
 
 
837 aa  75.1  3e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.41 
 
 
379 aa  72  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.06 
 
 
362 aa  72.4  2e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  23.45 
 
 
833 aa  71.2  4e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  23.34 
 
 
580 aa  68.6  3e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  23.3 
 
 
791 aa  62.8  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  28.7 
 
 
234 aa  60.8  5e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  27.7 
 
 
264 aa  60.8  5e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  27.5 
 
 
235 aa  60.1  1e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
202 aa  58.5  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  23.43 
 
 
238 aa  58.2  4e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  27.5 
 
 
235 aa  58.2  4e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
425 aa  57.8  5e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.46 
 
 
191 aa  57  9e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.6 
 
 
252 aa  56.6  1e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
358 aa  57  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  26.37 
 
 
333 aa  55.8  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  24.12 
 
 
317 aa  55.5  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  24.37 
 
 
379 aa  55.5  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  25.58 
 
 
298 aa  56.2  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  26.83 
 
 
196 aa  55.5  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  26.45 
 
 
205 aa  54.3  6e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  23.17 
 
 
246 aa  53.9  8e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  23.11 
 
 
281 aa  53.5  9e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  27.43 
 
 
213 aa  53.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  25.12 
 
 
379 aa  53.1  1e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  23.44 
 
 
268 aa  52.8  2e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
393 aa  52.4  2e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
431 aa  52.8  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  24.79 
 
 
277 aa  52.4  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.47 
 
 
700 aa  51.2  4e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>