129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1826 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  100 
 
 		 516 aa  1033    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  58.69 
 
 		 558 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  57.62 
 
 		 537 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  47.27 
 
 		 605 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  41.75 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  40.12 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  38.68 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  42.45 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  38.23 
 
 		 609 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  37.55 
 
 		 606 aa  329  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  37.25 
 
 		 558 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  37.25 
 
 		 558 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  37.45 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 603 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  35.9 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.34 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.94 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.94 
 
 		 552 aa  292  8e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  33.27 
 
 		 552 aa  290  4e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.26 
 
 		 576 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 779 aa  106  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.44 
 
 		 877 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.44 
 
 		 875 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 		 800 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.29 
 
 		 877 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 833 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 940 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 912 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 919 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  33.47 
 
 		 936 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  34.83 
 
 		 834 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 920 aa  93.6  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 922 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 828 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 849 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 919 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 952 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 931 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 828 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.6 
 
 		 869 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.1 
 
 		 827 aa  90.9  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.44 
 
 		 920 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 921 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 869 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  24.91 
 
 		 897 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  25.92 
 
 		 803 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.61 
 
 		 948 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 823 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  31.12 
 
 		 846 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 915 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.17 
 
 		 869 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 1055 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 977 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 910 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 947 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.02 
 
 		 781 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 828 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 830 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 837 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 837 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 837 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  23.14 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.64 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  24.73 
 
 		 830 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 852 aa  63.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.64 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.11 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.94 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  20.46 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  24.6 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  24.9 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  23.98 
 
 		 580 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  27.5 
 
 		 208 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  31.61 
 
 		 238 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 495 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 184 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 281 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  22.88 
 
 		 992 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 243 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  27.95 
 
 		 232 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>