More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4037 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  94.47 
 
 		 235 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  73.62 
 
 		 234 aa  317  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  62.08 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  60.5 
 
 		 213 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  59.84 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  62.61 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  59.66 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  54.04 
 
 		 196 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  55.33 
 
 		 190 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  56 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  52.67 
 
 		 192 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  52.67 
 
 		 192 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  52 
 
 		 192 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  52 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  52.98 
 
 		 187 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  48.48 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  47.88 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  48.48 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  50.31 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  50.99 
 
 		 189 aa  151  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  47.85 
 
 		 191 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  46.63 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  43.14 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  48 
 
 		 191 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  45.73 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  45.09 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  51.66 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.34 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  36.94 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  41.51 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  36.42 
 
 		 185 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  42.07 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.56 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  38.27 
 
 		 175 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.33 
 
 		 153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.25 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  31.41 
 
 		 177 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  43.97 
 
 		 419 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  30.77 
 
 		 177 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.44 
 
 		 152 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  42.37 
 
 		 437 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.24 
 
 		 455 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.97 
 
 		 455 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  39.87 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  35.22 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 439 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 184 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  35.17 
 
 		 427 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  40 
 
 		 459 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  36.92 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.96 
 
 		 422 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  39.62 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  39.62 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  39.85 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  32.45 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  32.45 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  37.7 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  37.27 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  32.28 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.61 
 
 		 816 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 417 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 441 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  36.04 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  41.96 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  41.96 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  41.07 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.67 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  38.39 
 
 		 410 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  36.21 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  36.21 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  36.21 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.06 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  30 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.99 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  35.71 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>