More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2182 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  100 
 
 
298 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  34.2 
 
 
351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  31.88 
 
 
356 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  32.46 
 
 
309 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  31.03 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.29 
 
 
387 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.35 
 
 
264 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.04 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  31.85 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  31.72 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.21 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.62 
 
 
388 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  28.9 
 
 
288 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.2 
 
 
264 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.47 
 
 
362 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.52 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  31.41 
 
 
356 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  27.27 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  42.74 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  41.94 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  26.62 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  27.52 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.33 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  34.24 
 
 
227 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  28.43 
 
 
407 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.71 
 
 
214 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  33.49 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  28.66 
 
 
408 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.92 
 
 
283 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  27.69 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.08 
 
 
473 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  28.5 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  28.71 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.07 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  39.53 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  38.76 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.62 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.65 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.62 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
193 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  26.49 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.32 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  37.98 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.56 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.56 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.56 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.46 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.46 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.46 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.68 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.46 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.27 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.42 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.2 
 
 
391 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  24.92 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
910 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  26.14 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.26 
 
 
431 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.17 
 
 
920 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  27.34 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  37.86 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  26.47 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  24.6 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  32.46 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  29.57 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  27.17 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.97 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.51 
 
 
920 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  31.94 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.59 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  35.2 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  23.66 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.25 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>