238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02816 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  100 
 
 		 558 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  99.64 
 
 		 558 aa  1140    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  51.29 
 
 		 606 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  45.54 
 
 		 603 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  43.52 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  38.49 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  36.14 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.96 
 
 		 552 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  38.26 
 
 		 552 aa  353  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.55 
 
 		 552 aa  351  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  37.94 
 
 		 579 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  39.02 
 
 		 557 aa  342  8e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  36.48 
 
 		 609 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  36.91 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 605 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 516 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.92 
 
 		 576 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 803 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 779 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  32.42 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 940 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 936 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  33.66 
 
 		 834 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 849 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.42 
 
 		 869 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  23.85 
 
 		 977 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.56 
 
 		 781 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 947 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 824 aa  93.6  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.41 
 
 		 877 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.7 
 
 		 800 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.35 
 
 		 800 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 952 aa  90.5  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.19 
 
 		 875 aa  90.5  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 753 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.08 
 
 		 877 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 920 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 830 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.19 
 
 		 869 aa  87.4  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 948 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 910 aa  86.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 920 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  22.83 
 
 		 1055 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  23.65 
 
 		 869 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 852 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.77 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  29.2 
 
 		 931 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  24.37 
 
 		 846 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  22.76 
 
 		 830 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 912 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 		 921 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 922 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 915 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 823 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 919 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.29 
 
 		 827 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  33.08 
 
 		 700 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  30.1 
 
 		 897 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  24.9 
 
 		 791 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  27.03 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  34.04 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 454 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  24.62 
 
 		 837 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  34.58 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 246 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 270 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.88 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.58 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.78 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.58 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25.33 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  25.81 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  30.25 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.34 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28 
 
 		 268 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  22.8 
 
 		 283 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  27.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.98 
 
 		 264 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>