More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3645 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  43.41 
 
 		 915 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  100 
 
 		 920 aa  1869    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  45.29 
 
 		 921 aa  770    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  42.16 
 
 		 920 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  44.18 
 
 		 912 aa  754    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  43.33 
 
 		 919 aa  761    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  42.09 
 
 		 931 aa  738    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  42.7 
 
 		 922 aa  718    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  38.93 
 
 		 897 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  43.51 
 
 		 919 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  42.91 
 
 		 910 aa  740    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  38.22 
 
 		 869 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  36.57 
 
 		 869 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  36.1 
 
 		 852 aa  555  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  40.28 
 
 		 828 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  40.03 
 
 		 828 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  38.32 
 
 		 827 aa  412  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  40.28 
 
 		 828 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  38.84 
 
 		 837 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  38.84 
 
 		 837 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  38.84 
 
 		 837 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  35.49 
 
 		 833 aa  345  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 948 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 947 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.68 
 
 		 833 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 753 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.18 
 
 		 781 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 834 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  29.32 
 
 		 812 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 800 aa  224  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  35.07 
 
 		 1055 aa  224  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 977 aa  217  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 940 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 952 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 824 aa  213  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 823 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 849 aa  210  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 869 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.88 
 
 		 830 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 846 aa  208  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 830 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 803 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  31.9 
 
 		 576 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.83 
 
 		 877 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.39 
 
 		 875 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.13 
 
 		 800 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.13 
 
 		 877 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.68 
 
 		 568 aa  162  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 580 aa  121  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 478 aa  118  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 605 aa  108  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  31.01 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.18 
 
 		 473 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.42 
 
 		 703 aa  101  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  22.58 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  22.37 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  25.39 
 
 		 609 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 425 aa  99.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  29.62 
 
 		 264 aa  99  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 603 aa  96.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 587 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.2 
 
 		 264 aa  95.9  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 565 aa  95.5  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 270 aa  94.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.37 
 
 		 495 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.65 
 
 		 552 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  25.62 
 
 		 606 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  30.31 
 
 		 358 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 516 aa  92  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.14 
 
 		 552 aa  92  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.49 
 
 		 552 aa  91.3  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.92 
 
 		 277 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.79 
 
 		 552 aa  90.5  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.96 
 
 		 393 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  30 
 
 		 558 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  26.2 
 
 		 282 aa  89.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  23.63 
 
 		 700 aa  89.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  30 
 
 		 558 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  30 
 
 		 558 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 347 aa  88.2  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 351 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.62 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  24.8 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.24 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.24 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.24 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.91 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 379 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.82 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.55 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 992 aa  83.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  30.91 
 
 		 606 aa  82  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.95 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  22.82 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>