293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1986 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  90.4 
 
 		 875 aa  1539    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 877 aa  1756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  92.75 
 
 		 800 aa  1451    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  50.14 
 
 		 779 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  89.74 
 
 		 877 aa  1520    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  43.84 
 
 		 849 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  40.73 
 
 		 753 aa  492  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  41.62 
 
 		 803 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  32.21 
 
 		 948 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 869 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  31.66 
 
 		 952 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 833 aa  288  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 977 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  29.43 
 
 		 940 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 1055 aa  238  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 936 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  33.84 
 
 		 834 aa  230  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.43 
 
 		 781 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 828 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  33.4 
 
 		 827 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  30.86 
 
 		 869 aa  210  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  40.89 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 837 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 837 aa  203  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  30.24 
 
 		 947 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 837 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  32.82 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.77 
 
 		 912 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 931 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 919 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 919 aa  193  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 920 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 915 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  36.04 
 
 		 910 aa  190  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 922 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  34.65 
 
 		 897 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  34.01 
 
 		 921 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 823 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 824 aa  180  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.12 
 
 		 833 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 869 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 830 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.83 
 
 		 920 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 791 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 830 aa  165  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 852 aa  160  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.7 
 
 		 846 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.01 
 
 		 568 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  31.14 
 
 		 812 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  44.06 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 565 aa  117  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 478 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 605 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  27.29 
 
 		 516 aa  104  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  25.55 
 
 		 557 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 580 aa  97.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.47 
 
 		 579 aa  95.5  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.36 
 
 		 552 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.63 
 
 		 552 aa  94  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  25.66 
 
 		 552 aa  93.6  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.36 
 
 		 552 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  30.16 
 
 		 587 aa  92.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.3 
 
 		 558 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.08 
 
 		 558 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.08 
 
 		 558 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  24.29 
 
 		 558 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.72 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  24.64 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 347 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  25.52 
 
 		 606 aa  76.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  24.27 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.16 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.23 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.59 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.39 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 392 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.45 
 
 		 205 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 392 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 252 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 387 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 392 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 387 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.73 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.35 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.05 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.41 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 379 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 351 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 379 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 348 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.34 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.82 
 
 		 348 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  24.22 
 
 		 606 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>