More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1375 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  52.29 
 
 
921 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  52.28 
 
 
919 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  71.24 
 
 
827 aa  1250    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  100 
 
 
837 aa  1699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  86.38 
 
 
828 aa  1507    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  86.38 
 
 
828 aa  1477    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  97.73 
 
 
837 aa  1634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  97.73 
 
 
837 aa  1634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  86.98 
 
 
828 aa  1517    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  61.62 
 
 
912 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  44.02 
 
 
920 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  42.87 
 
 
910 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  43.21 
 
 
919 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  36.68 
 
 
869 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  59.5 
 
 
915 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  37.96 
 
 
852 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  58.13 
 
 
931 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  39.29 
 
 
833 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  56.6 
 
 
922 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  43.07 
 
 
897 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.84 
 
 
920 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  34.72 
 
 
948 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.5 
 
 
1055 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  34.36 
 
 
781 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  32.43 
 
 
834 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.23 
 
 
869 aa  363  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.15 
 
 
833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
869 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  29.99 
 
 
977 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.05 
 
 
952 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.68 
 
 
936 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  31.93 
 
 
940 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.49 
 
 
830 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
800 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
846 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.88 
 
 
824 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
849 aa  288  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  29.64 
 
 
812 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  28.22 
 
 
791 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.96 
 
 
823 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.76 
 
 
947 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.91 
 
 
568 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.3 
 
 
830 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  29.99 
 
 
753 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  33.13 
 
 
779 aa  247  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.95 
 
 
877 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.38 
 
 
877 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.99 
 
 
800 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  31.76 
 
 
875 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.96 
 
 
803 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  33.44 
 
 
576 aa  189  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.56 
 
 
580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.47 
 
 
478 aa  127  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  35 
 
 
425 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  28.88 
 
 
605 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.5 
 
 
606 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.29 
 
 
552 aa  101  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.06 
 
 
579 aa  99.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  22.14 
 
 
700 aa  98.2  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.87 
 
 
552 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.33 
 
 
387 aa  94.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.78 
 
 
551 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  28.95 
 
 
552 aa  94.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.43 
 
 
552 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  22.27 
 
 
700 aa  94  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.24 
 
 
388 aa  92  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
379 aa  92  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  29.69 
 
 
537 aa  91.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.89 
 
 
516 aa  91.3  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.26 
 
 
609 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.99 
 
 
431 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
558 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
508 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  24.11 
 
 
495 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  24 
 
 
992 aa  88.6  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.86 
 
 
495 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  22.75 
 
 
603 aa  88.2  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.62 
 
 
495 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  24.16 
 
 
606 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  28.03 
 
 
587 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.13 
 
 
703 aa  82.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.51 
 
 
362 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
386 aa  82  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
557 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.68 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  24.88 
 
 
373 aa  82  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.95 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.26 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  24.47 
 
 
365 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.36 
 
 
358 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
392 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
392 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.05 
 
 
379 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  24.9 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>