More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2464 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  94.47 
 
 
235 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  75.74 
 
 
234 aa  318  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  61.67 
 
 
238 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  59.31 
 
 
213 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  59.04 
 
 
247 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  61.9 
 
 
220 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  58.87 
 
 
219 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  54.04 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  54.67 
 
 
190 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  54.67 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  52 
 
 
192 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  52 
 
 
192 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  51.33 
 
 
192 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  51.33 
 
 
195 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  50 
 
 
196 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  50 
 
 
195 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  52.94 
 
 
187 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  49.4 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  50.31 
 
 
186 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  47.85 
 
 
191 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  46.63 
 
 
191 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  48.37 
 
 
189 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  42.48 
 
 
200 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  45.73 
 
 
208 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  48.34 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  43.93 
 
 
216 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.9 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  37.58 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  50.33 
 
 
196 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  37.09 
 
 
185 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  41.51 
 
 
177 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  41.46 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.34 
 
 
185 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.91 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  35.26 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.33 
 
 
153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.62 
 
 
178 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  32.05 
 
 
177 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.91 
 
 
193 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.44 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.69 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  31.41 
 
 
177 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  43.1 
 
 
419 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.97 
 
 
455 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.24 
 
 
455 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.77 
 
 
152 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  41.53 
 
 
437 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.56 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.42 
 
 
439 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.59 
 
 
205 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
184 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  40 
 
 
459 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  33.79 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  33.85 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  37.96 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  36.15 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.15 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  39.1 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  38.68 
 
 
415 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  37.7 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  35.12 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  38.68 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.17 
 
 
435 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  32.45 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  32.56 
 
 
423 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  32.56 
 
 
423 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  32.45 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  37.29 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  32.56 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.61 
 
 
816 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.79 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.86 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  29.33 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  36.04 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  31.5 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  36.76 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  36.17 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  36.17 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.07 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.46 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.67 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  36.44 
 
 
417 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.14 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  35.48 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.06 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  37.25 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  35.71 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  37.5 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.48 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.76 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>