182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4938 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  100 
 
 
603 aa  1222    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  52.85 
 
 
606 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  47.09 
 
 
606 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  45.54 
 
 
558 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  45.74 
 
 
558 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  45.54 
 
 
558 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.17 
 
 
552 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  37.95 
 
 
579 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.48 
 
 
552 aa  345  8.999999999999999e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.45 
 
 
552 aa  346  8.999999999999999e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.65 
 
 
552 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  37.7 
 
 
587 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  41.68 
 
 
565 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  34.31 
 
 
605 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  37.18 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  31.46 
 
 
609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  35.16 
 
 
537 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  35.58 
 
 
516 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  35 
 
 
558 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.17 
 
 
576 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  23.31 
 
 
833 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.03 
 
 
834 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
852 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  33.82 
 
 
803 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  26.63 
 
 
948 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.51 
 
 
910 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
922 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  27.6 
 
 
830 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.32 
 
 
897 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.23 
 
 
869 aa  100  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.57 
 
 
931 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.84 
 
 
920 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.03 
 
 
936 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
921 aa  98.2  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  27.66 
 
 
952 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28.47 
 
 
753 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.02 
 
 
827 aa  97.8  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
869 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
919 aa  97.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  25 
 
 
915 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
869 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.14 
 
 
781 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  25.11 
 
 
779 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  32.64 
 
 
947 aa  94  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.69 
 
 
920 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.45 
 
 
912 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.27 
 
 
919 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
977 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  25.27 
 
 
800 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  23.63 
 
 
828 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  23.09 
 
 
828 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  26.98 
 
 
849 aa  90.5  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25.92 
 
 
1055 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  24.03 
 
 
830 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  23.61 
 
 
824 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  24.4 
 
 
823 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.4 
 
 
940 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  23.65 
 
 
791 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  21.99 
 
 
837 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  21.99 
 
 
837 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  22.46 
 
 
828 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  21.99 
 
 
837 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  27.78 
 
 
812 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  22.65 
 
 
877 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.65 
 
 
875 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  22.47 
 
 
800 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  24.03 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  23.3 
 
 
846 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  33.13 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.19 
 
 
877 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.15 
 
 
833 aa  64.7  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.89 
 
 
478 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
454 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
384 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
246 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  29.05 
 
 
700 aa  60.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  30 
 
 
425 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.38 
 
 
205 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.88 
 
 
495 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.88 
 
 
495 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.95 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  24.58 
 
 
268 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  32.87 
 
 
456 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.82 
 
 
508 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.74 
 
 
473 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.74 
 
 
351 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.47 
 
 
388 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
580 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.09 
 
 
358 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.65 
 
 
492 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.06 
 
 
352 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  25 
 
 
390 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
286 aa  53.9  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  24.05 
 
 
362 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.66 
 
 
270 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  29.21 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.7 
 
 
551 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  24.43 
 
 
415 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>