More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2222 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  43.38 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  45.32 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  43.75 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  47.79 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  44.44 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  42.42 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  40.3 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  45.38 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  44.03 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 388 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.86 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  32.03 
 
 		 992 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 371 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30.4 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 376 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  32.65 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.09 
 
 		 386 aa  95.5  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  28.57 
 
 		 377 aa  95.5  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.17 
 
 		 333 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 478 aa  89.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  39.88 
 
 		 213 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.39 
 
 		 375 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 431 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  35 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  37.65 
 
 		 192 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.95 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.95 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 377 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.95 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 192 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 192 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.95 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.95 
 
 		 386 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.47 
 
 		 386 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.02 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 992 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 823 aa  82.4  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.76 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.68 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.25 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  26.83 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 580 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.37 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.37 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.37 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.65 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.9 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.48 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.37 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.37 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.48 
 
 		 183 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.2 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.6 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  30.49 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.02 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.02 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.02 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>