189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001787 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  63.29 
 
 		 587 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  100 
 
 		 579 aa  1181    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  54.64 
 
 		 609 aa  614  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  44.99 
 
 		 605 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  43.06 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  45.21 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  44.29 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  41.84 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  41.75 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  38.04 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  37.95 
 
 		 603 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.31 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  39.23 
 
 		 552 aa  353  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  39.23 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  36.76 
 
 		 606 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  38.95 
 
 		 552 aa  343  7e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  37.94 
 
 		 558 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  37.94 
 
 		 558 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  37.75 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.25 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  24.58 
 
 		 803 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 947 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  25.34 
 
 		 824 aa  110  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  25 
 
 		 940 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 849 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.36 
 
 		 828 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.12 
 
 		 828 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 977 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  31 
 
 		 852 aa  104  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 920 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.77 
 
 		 781 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 922 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.71 
 
 		 827 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 779 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 800 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 931 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 952 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 948 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  25.68 
 
 		 936 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.84 
 
 		 912 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 915 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 921 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.26 
 
 		 875 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 919 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  23.32 
 
 		 812 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.05 
 
 		 877 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.94 
 
 		 800 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 919 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.95 
 
 		 869 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  23.49 
 
 		 830 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.01 
 
 		 920 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  23.6 
 
 		 846 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 869 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.47 
 
 		 877 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 910 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.27 
 
 		 869 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  22.48 
 
 		 830 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  24.13 
 
 		 823 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 753 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  24.36 
 
 		 828 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  22.96 
 
 		 833 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  23.04 
 
 		 791 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  24.55 
 
 		 897 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  25.8 
 
 		 837 aa  87  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  25.8 
 
 		 837 aa  87  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  23.2 
 
 		 1055 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  25.34 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  23.76 
 
 		 833 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  23.62 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  22.06 
 
 		 700 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  23 
 
 		 551 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.71 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  34.03 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.17 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  28.67 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.35 
 
 		 317 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.55 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  26.35 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  27.54 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.28 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 196 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 253 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 191 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  29.86 
 
 		 153 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 375 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.91 
 
 		 268 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 190 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.86 
 
 		 495 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>