More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2236 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  48.23 
 
 		 834 aa  749    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  65.93 
 
 		 781 aa  1073    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  67.14 
 
 		 568 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  48.81 
 
 		 833 aa  760    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  48.98 
 
 		 869 aa  721    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  100 
 
 		 948 aa  1920    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  43.75 
 
 		 936 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  48.16 
 
 		 977 aa  723    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  46.28 
 
 		 952 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  40.73 
 
 		 1055 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  37.64 
 
 		 940 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  34.62 
 
 		 827 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  35.65 
 
 		 828 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 828 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  34.53 
 
 		 837 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  34.53 
 
 		 837 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  34.18 
 
 		 837 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  35.7 
 
 		 828 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 849 aa  366  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 779 aa  346  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  57.19 
 
 		 425 aa  341  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  32.15 
 
 		 833 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.71 
 
 		 800 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.71 
 
 		 877 aa  327  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  31.71 
 
 		 875 aa  327  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.48 
 
 		 877 aa  324  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  30.42 
 
 		 823 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 919 aa  295  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 824 aa  294  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  36.06 
 
 		 753 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 846 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.75 
 
 		 947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 830 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 830 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.63 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 919 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 931 aa  262  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 869 aa  260  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 920 aa  259  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  32.62 
 
 		 869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  31.64 
 
 		 921 aa  251  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.86 
 
 		 920 aa  247  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 915 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  31.19 
 
 		 912 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 910 aa  240  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 800 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.72 
 
 		 897 aa  238  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 922 aa  238  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 791 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 852 aa  225  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  33.33 
 
 		 576 aa  201  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 580 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 478 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 565 aa  114  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.32 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 473 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  25.84 
 
 		 552 aa  109  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 605 aa  108  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  33.62 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  37.43 
 
 		 552 aa  106  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  37.99 
 
 		 557 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  36.87 
 
 		 552 aa  105  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.96 
 
 		 552 aa  104  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  24.95 
 
 		 700 aa  104  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 270 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 603 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 508 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 992 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.74 
 
 		 579 aa  101  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  24.89 
 
 		 606 aa  101  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 379 aa  100  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.35 
 
 		 388 aa  96.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 347 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 264 aa  95.9  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 992 aa  96.3  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 281 aa  95.5  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  23.21 
 
 		 551 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  25.05 
 
 		 609 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  32.41 
 
 		 358 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 478 aa  92  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  31.34 
 
 		 606 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.15 
 
 		 277 aa  89.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  33.5 
 
 		 537 aa  89.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 492 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  34.72 
 
 		 558 aa  89  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 387 aa  88.6  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.19 
 
 		 373 aa  88.6  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  25.61 
 
 		 516 aa  88.2  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.05 
 
 		 362 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  24.22 
 
 		 495 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  31.94 
 
 		 262 aa  87.4  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.91 
 
 		 495 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 372 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  33.16 
 
 		 558 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  33.16 
 
 		 558 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  33.16 
 
 		 558 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>