More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2264 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  71.33 
 
 		 828 aa  1207    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  72.05 
 
 		 828 aa  1243    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  100 
 
 		 827 aa  1675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  72.17 
 
 		 828 aa  1245    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  71.24 
 
 		 837 aa  1225    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  71.6 
 
 		 837 aa  1226    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  71.72 
 
 		 837 aa  1226    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  63.16 
 
 		 919 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  44.7 
 
 		 910 aa  626  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  44.01 
 
 		 920 aa  618  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  50.53 
 
 		 921 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  44.65 
 
 		 919 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  59.96 
 
 		 931 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  39.22 
 
 		 869 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  60.21 
 
 		 912 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  41.31 
 
 		 833 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  60.17 
 
 		 915 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  42.42 
 
 		 922 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  35.25 
 
 		 869 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  36.99 
 
 		 852 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 948 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.32 
 
 		 920 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  33.52 
 
 		 1055 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.02 
 
 		 781 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  34.5 
 
 		 869 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  40.94 
 
 		 897 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 834 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.49 
 
 		 936 aa  353  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 952 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 977 aa  343  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.43 
 
 		 940 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 830 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 846 aa  297  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  31.04 
 
 		 812 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 824 aa  291  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 800 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 791 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.04 
 
 		 823 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 753 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 830 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.93 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 779 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 947 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  37.58 
 
 		 849 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.4 
 
 		 877 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.13 
 
 		 877 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  32.93 
 
 		 875 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.13 
 
 		 800 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 803 aa  208  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  41.89 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 580 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.87 
 
 		 478 aa  124  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 551 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 425 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.44 
 
 		 606 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  24.84 
 
 		 605 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  22.63 
 
 		 700 aa  104  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.25 
 
 		 552 aa  103  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.71 
 
 		 579 aa  103  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.88 
 
 		 552 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 473 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.88 
 
 		 552 aa  100  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 508 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 603 aa  97.8  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.29 
 
 		 609 aa  97.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.39 
 
 		 703 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.71 
 
 		 552 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  32.29 
 
 		 537 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  22.07 
 
 		 700 aa  94.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  33.52 
 
 		 587 aa  94.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 516 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 388 aa  90.9  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 387 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  24.95 
 
 		 606 aa  89.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 558 aa  88.6  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.31 
 
 		 495 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.44 
 
 		 373 aa  84  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 992 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 379 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.16 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  22.9 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  22.48 
 
 		 992 aa  82  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.85 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.85 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.85 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.85 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.85 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  24.1 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.03 
 
 		 347 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 374 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 268 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 351 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  26 
 
 		 565 aa  77.4  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  22.29 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.1 
 
 		 282 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  22.29 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>