294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2408 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.87 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.22 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  35.2 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  31.8 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  36.45 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  37.41 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  35.57 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  26.97 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.57 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  28.14 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 922 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  33.85 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  28.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 833 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 834 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.61 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  31.84 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  32.54 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  28.24 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  32.2 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 1055 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 828 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 919 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 828 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 379 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 492 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  35.03 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2859  polysaccharide export protein  35.03 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.27 
 
 		 429 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  32.54 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 977 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  33.09 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 920 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.77 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  27.71 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 912 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3007  exopolysaccharide transporter  31.72 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 948 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 869 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 495 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  25.81 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>